A rémálmukból ébredünk a pláza eggyik büféjében. Elhagyva azt megnyugtatjuk apánkat, hogy nemsokára otthonleszünk. Közben egy furcsa külselyű detektívvel találkozunk, akit nehezen sikerült leráznunk. Douglas (a detektív) elmondta, hogy valaki nyomozott utánunk, és szeretne velünk találkozni. Majd a plázában a könyvesboltból kilépve találkozunk Claudiával. Ő elmondta nekünk, hogy hamarosan ujjászületik a menyország, és ebben nekünk is jelentős szerepünk lessz, csak vissza kell emlékeznünk a régebbi énünkre. A jelenléte fúrcsa fejfájást okoz, és eltűnik. Később, kiútban a plázából újra Dougles-be botlunk. Annyit mond, hogy őt Claudia bérelte fel előkeresésünkre. Mi persze még mindíg nem bízunk benne, és sietve eltávozunk.Amikor hazaértük, legnagyobb megdöbbenésünkre apánk vérbefagyva, holtan fekszik a földön. Ahogy elkezdtük követni a tettes nyomait, Claudiára bukkantunk. Elmondta, hogy bosszút állt, amiért az apánk elvett minket tőle, és másrészt fel kellett tölteni a szívünket haraggal, hogy készenálljunk az isteni feladatra. Meghagyta, hogy Silent Hillben vár ránk. Odabent ismét találkozunk Douglas-szel, aki lelkifurdalást érez a történtek miatt, és elvisz minket Silent Hillbe. A kocsiában emlékezni kezdünk, rájövünk, hogy Claudia testvérének, Alessának vagyunk a gyereke. Alessát a saját anyja áldfozta fel a hitéért. Apánk ölte meg az istent, akit Alessa szűlt, és örökbefogadott minket. Claudia általunk akarja újrateremteni az istenét. A kórházban Leonard hív minket, és elmondja, hogy ő Claudia apja, és hogy ő is szeretné megállítani a lányát, és ehhez a segítségünket kéri. Később találkozunk is vele, és megtudjuk, hogy csak ugratott bennünket, és ő is ügyanazt akarja, mint Claudia. Ő már többet nem fog az utunkba kerülni
. Mikor a motelbe érünk Vincent vár ránk, és elmondja, hogy Claudia a tó másik olalán lévő templomban van, és ehhez a vidámparkon keresztül vezet az út. A vidámparkból kijutva találkozunk Duglas-szel, és egy megindító beszélgetés tanúi lehetünk. Ezután meg is indulunk- pontot tenni a történet végére . A vidámparkban találkozunk Alessa emlékével, és meg is kűzdünk vele. A templomban pedig Claudiával, és megpróbálunk a lelkére beszélni (nem sok sikerrel). A beszélgetés közben rosszul leszünk, és Claudia közli velünk, hogy az "isten", aki bennünk van, egyre növekszik, és nemsokára mi vehetjük át az irányítást. Kicsit később Vincent és Claudia között harc keletkezik, amiből Vincent kerül ki vesztesen. Hirtelen rosszul leszünk, és Claudiával a béltartalmunk gazdát cserél, amit ő nehezen visel. Ezért tőle is búcsút kell vennünk, és a legyőzése után jönnek a végső képsorok...
